全人类被神奇的现象一瞬间石化后过了几千年——拥有超人般头脑、天生的科学少年·千空苏醒了。
在文明遭到毁灭的石头世界里，千空集结新伙伴的力量一起建立“科学王国”，最终目标是用科学的力量复原整个世界。但是，由灵长类最强的高中生狮子王司领导的“武装帝国”却步步为营。旨在净化人类的司试图通过使用强大的力量来阻止科学的发展。
科学 vs 武力的战斗经过激战，千空等人的科学王国占优势，之后两国终于和解。
由于同伴的谋反而处于冷休眠状态的司为了复活全人类，科学王国以石化光线的发生源、地球的背面·新世界作为目标！
冲出世界解开石化之谜！石头世界大航海时代终于开幕——‼
悠木碧 斋藤千和 水桥香织 喜多村英梨 加藤英美里 野中蓝 阿澄佳奈 后藤邑子 岩永哲哉 吉田圣子 新谷良子 岩男润子 松冈祯丞 赤崎千夏 五十岚裕美 上田丽奈 木岛隆一 河西健吾 阿座上洋平 前田邦宏