第三期 银河
时空之石事件之后，在圣光之路大赛足球场即将举办全新闪电日本选拔，在获选的选手中，除了天马、剑城以及神童外，全是在其他学校首次踢球的运动选手，他们要如何整顿球队迎接世界的挑战呢？
此队与剧场版《闪电十一人GO VS纸箱战机》的新生闪电日本队并无关系，是由黑岩监督亲自从日本挑选而组成的球队。
除了雷门的三巨头外，其他八名都是从参加神圣之路的队伍的板凳里选出来，且八人均是踢足球的新手。
目前新生闪电日本队没有板凳成员。
在世界大赛中禁止使用化身（所以更别说极限和体了）。
浅野真澄 日野聪 甲斐田裕子 真堂圭 生天目仁美 茅原实里 门胁舞以 浅川悠 赤城进 阪口周平 武田华 斋藤千和 高桥智秋 田边留依 巽悠衣子 五十岚裕美 小清水亚美 藤村步 江川央生 井上穗乃花 高桥未奈美 伊藤静 龟山雄慈 大桥彩香
福山润 古川慎 田村睦心 日冈夏美 松冈祯丞 细谷佳正 田丸笃志 日笠阳子 石原夏织 酒井广大 间岛淳司 小野大辅 西山宏太朗 土岐隼一 伊濑茉莉也 岛崎信长 村瀬步 速水奖